Agencija ima pečat, ki ima obliko kroga. Premer velikega pečata znaša 30 mm, manjšega pa 20 mm.
Pečat agencije je obrobljen z dvema koncentričnima krogoma in vsebuje na obodu besedilo: “Agencija Republike Slovenije za plačilni promet”, v sredini pa navedbo sedeža, ki glasi: “Ljubljana”.
Pečati organizacijskih enot in ekspozitur vsebujejo poleg imena agencije tudi navedbo organizacijskih enot oziroma organizacijske enote in ekspoziture.
Pečati agencije, organizacijske enote ter njihovih ekspozitur imajo v spodnjem delu zaporedno številko izdelave.
Na narodnostno mešanem območju se uporabljajo pečati z besedilom v slovenskem jeziku in jeziku narodnosti.
Agencija, organizacijske enote in ekspoziture imajo tudi žig in štampiljke. Obliko, velikost ter vrsto žigov in štampiljk določi generalni direktor.