Vodilni delavci oziroma delavci s posebnimi pooblastili in odgovornostmi so: namestnik generalnega direktorja, pomočniki generalnega direktorja, direktorji območnih služb in direktor centralne službe.
Namestnika in pomočnike ima generalni direktor zavoda za posamezne dejavnosti, opredeljene s pravilnikom o notranji organizaciji.
Delo območnih služb organizirajo in vodijo direktorji območnih služb.
Za vodenje centralne službe ima generalni direktor lahko direktorja centralne službe.
Obseg pooblastil vodilnih delavcev se določi s pravilnikom o sistemizaciji delovnih mest.