V 27.a členu se tretji odstavek spremeni tako, da se glasi:
»(3)
Objekti za premostitev Glinščice so oblikovani tako, da konstrukcija v prečnem prerezu tudi v primeru iztirjenja vlaka preprečuje, da bi se kompozicija prevrnila v dolino Glinščice. Konstrukcija se oblikuje tudi kot ustrezna protihrupna zaščita. Sistem odvodnjavanja na objektih je speljan v poseben zbiralnik (sedimentacijski bazen), ki omogoča, da se v primeru razlitja na železniški progi razlite tekočine zbirajo v lovilni bazen, iz katerega je mogoče prečrpati onesnaženo vodo v cisterne in jo prepeljati v čistilno napravo. Sedimentacijski bazen je dovolj velik, da zadošča potrebam levega in desnega tira in bo zgrajen že v prvi fazi (enotirnost).«.
Za štirinajstim odstavkom se dodajo novi petnajsti, šestnajsti in sedemnajsti odstavek, ki se glasijo:
»(15)
Izvesti je treba ukrepe za preprečitev stekanja onesnaženih padavinskih odpadnih voda iz gradbišča v strugo Glinščice (npr. z betonsko varovalno ograjo, zatesnjenimi stiki, ureditvijo naklona na način, da vsa padavinska voda gravitira proč od brežine vodotoka). Zajeto onesnaženo vodo iz gradbišča je treba prečistiti ter ponovno uporabiti v tehnološkem procesu gradnje, višek pa odpeljati v nadaljnjo predelavo pooblaščenemu zbiralcu, brez izpustov v naravo.
(16)
Pred izvedbo posegov na strme brežine nad vodotokom Glinščica je treba zaščititi strugo Glinščice pred vsipom izkopnega materiala s fizično zaščito struge (začasno prekritje najbolj izpostavljenega dela struge) in postavitvijo fizičnih ovir, nameščenih na brežino nad strugo Glinščice (zagatne stene, palisade).
(17)
Sestavni del projektne dokumentacije je tudi načrt ureditve gradbišč in dovoznih poti ter načrt krajinske arhitekture, ki morata biti pred začetkom gradnje usklajena s pristojno enoto Zavoda Republike Slovenije za varstvo narave.«.