Tranzitni vizum se na mejnem prehodu izjemoma izda tujcu za enkratno potovanje preko državnega ozemlja Republike Slovenije v petih dneh, če se izkaže, da tujec zaradi nepredvidljivih oziroma nujnih razlogov iz drugega odstavka 10. člena tega navodila ni mogel pridobiti vizuma na diplomatsko konzularnem predstavništvu in ni razlogov za zavrnitev tujca, prekinitev potovanja pa bi povzročila dodatne stroške.
Od tujca se lahko zahteva dokazilo, da mu je zagotovljen vstop v državo, v katero potuje.
Kot dokazilo za vstop v tretjo državo se upoštevajo veljavni vizum te države ali druge listine iz katerih je mogoče nedvoumno ugotoviti, da mu bo vstop v to državo dovoljen.
Organ mejne kontrole pred izdajo tranzitnega vizuma lahko preveri, ali bo tujcu dovoljen vstop v drugo državo, oziroma preveri izvirnost izdanega vizuma za vstop v drugo državo.