Urad je vladna služba in opravlja naslednje strokovne naloge oziroma izvršuje zakonsko določene naloge na naslednji način:
Predlaga Vladi Republike Slovenije (v nadaljnjem besedilu: vlada) v sprejem standarde za fizično, organizacijsko in tehnično varovanje tajnih podatkov. Pri pripravi standardov za varstvo tajnih podatkov sodeluje z drugimi organi, še zlasti z Generalno policijsko upravo in Slovensko obveščevalno-varnostno agencijo. Pri pripravi standardov za varstvo tajnih podatkov pri elektronskem poslovanju urad sodeluje s Centrom vlade za informatiko.
Za posamezne vrste splošnih aktov organov lahko urad izdaja priporočila, vzorčne akte itd.
Urad je dolžan zagotoviti ustrezno varovanje podatkov iz navedene evidence.
Za zaposlene v Slovenski obveščevalno-varnostni agenciji, Obveščevalno-varnostni službi Ministrstva za obrambo in v Upravi kriminalistične policije Generalne policijske uprave, ki opravljajo operativno delo izven prostorov organa, se ne sporoča identifikacijskih podatkov iz prvega odstavka te točke, če bi njihovo razkritje lahko povečalo nevarnost za njihovo zdravje ali življenje. V teh primerih se navede samo podatek o zasedbi delovnega mesta ter o stopnji tajnosti podatkov, do katerih oseba lahko dostopa.
Navedene podatke in njihove spremembe so uradu dolžni tekoče sporočati državni organi in službe, ki so pristojne za varnostno preverjanje.