Po izdelavi zaupnega dokumenta z oznako “državna tajnost” ali “uradna tajnost – strogo zaupno” je treba uničiti pomožno gradivo (npr. izračune in grafikone, skice, poskusne oziroma neuspešne izpise ipd.), ki je nastalo pri izdelavi dokumenta. Arhivi zaupne dokumentacije se v skladu z arhivsko klasifikacijo in roki komisijsko uničijo. O komisijskem uničenju arhivov sestavi komisija zapis, ki ga podpišejo vsi člani. Komisijo, ki jo sestavljajo trije člani, določi predstojnik.
Postopek uničevanja dokumentov z oznako “uradna tajnost – zaupno” in uradna tajnost – interno” odredi predstojnik. Pomožna gradiva iz prvega odstavka tega člena se uničujejo strojno ali na drug običajen način.
Generalni sekretar ministrstva s posebnim navodilom določi način in postopke uničevanja zaupnih dokumentov.