Na vsaki seji komisije se določi dnevni red naslednje seje. Dnevni red seje razpošlje predsednik najmanj štirinajst koledarskih dni pred sejo članom komisije, pristojnemu organu, po ustanovitvi agencije pa tudi VURS. Član komisije, ki se seje ne more udeležiti, mora o tem predhodno obvestiti predsednika.
Komisija lahko zaseda, sprejema strokovna mnenja, odloča in sprejema predloge, če so na seji prisotni predsednik ali podpredsednik ter vsaj trije člani komisije. V primeru neodločenega izida glasovanja je odločilen glas predsednika, v njegovi odsotnosti pa podpredsednika.