Doktorski študij se sofinancira na podlagi javnega razpisa, ki ga pripravijo in objavijo visokošolski zavodi v skladu s predpisi, ki urejajo izvajanje postopkov pri porabi sredstev evropske kohezijske politike, ter na podlagi smernic in strateških usmeritev ministrstva, pristojnega za visoko šolstvo.
Medsebojna razmerja, pravice in obveznosti pri izvedbi javnega razpisa med ministrstvom, pristojnim za visoko šolstvo, in visokošolskim zavodom se uredijo s pogodbo.