Organizacija, sistemizacija ter vrednotenja delovnih mest in druga vprašanja, povezana z delovanjem sklada, se podrobneje uredijo z aktom o notranji organizaciji in sistemizaciji delovnih mest, ki ga sprejme direktor s soglasjem nadzornega sveta sklada.
Delovna razmerja, plače in drugi prejemki javnih uslužbencev v skladu se urejajo v skladu z Zakonom o javnih uslužbencih, Zakonom o sistemu plač v javnem sektorju ter drugimi predpisi, ki veljajo oziroma se uporabljajo za javne uslužbence v državni upravi.