Predlagatelj, ki meni, da njegov predlog iz neupravičenih razlogov ni bil izbran oziroma je iz neupravičenih razlogov prejel bistveno manj sredstev, lahko v roku osem dni po prejemu obvestila iz prve točke prvega odstavka 20. člena tega pravilnika pisno vloži na ministrstvo ugovor.
Ministrstvo mora ugovor obravnavati in preveriti nove navedbe, minister pa v roku petnajst dni od prejema ugovora ponovno odloči s sklepom.
Zoper sklep ministra o ugovoru ni rednega pravnega sredstva, možen je le upravni spor.