O sprejemu subjektov v Dom podiplomcev na podlagi izvedenega javnega razpisa odloča Komisija za sprejem v Dom podiplomcev.
Komisijo za sprejem v Dom podiplomcev imenuje svet. Sestavljena je iz petih članov, in sicer sta dva člana predstavnika Ministrstva za šolstvo, znanost in šport, en član predstavnik visokošolskih zavodov, en član predstavnik stanovalcev Doma podiplomcev in en član predstavnik Društva mladih raziskovalcev. Predsednika komisije za sprejem v Dom podiplomcev izvolijo člani Komisije za sprejem z večino glasov vseh članov.
O pritožbah zoper odločitve Komisije za sprejem odloča Komisija za pritožbe
Člane Komisije za pritožbe imenuje svet. Komisija za pritožbe je sestavljena iz treh članov, in sicer je en član predstavnik Ministrstva za šolstvo, znanost in šport, en član predstavnik visokošolskih zavodov in en član predstavnik sveta. Predsednik Komisije za pritožbe je predstavnik Ministrstva za šolstvo, znanost in šport.