Osnovna in druga materialna sredstva, s katerimi upravlja zavod, so last Republike Slovenije. Zavod odgovarja za upravljanje s premoženjem ustanovitelju.
Zavod mora uporabljati in upravljati premoženje ustanovitelja s skrbnostjo dobrega gospodarja.
Zavod prevzame v upravljanje vsa osnovna in druga materialna sredstva, ki so po zakonu o veterinarstvu postala last Republike Slovenije.