Avtocesta ne poteka po zavarovanem območju podtalnice. Na celotnem odseku izgradnje avtoceste ter z njo povezanih ureditev je treba upoštevati in izvajati naslednje pogoje in ukrepe:
-
izogibati se je treba vsem začasnim posegom v stoječe vode, vodotoke ali njihove vplivne pasove,
-
v potoke ali v bližino potokov ter v vodne ali močvirske biotope ni dovoljeno odlagati gradbeni ali izkopani material ali izpuščati odpadne snovi ali odpadke,
-
z rečno ali jezersko vodo ni dovoljeno splakovati delovnih orodij in gradbenih strojev
-
z odpadnimi in izcednimi vodami, ki nastajajo na gradbenih površinah in v infrastrukturnih objektih na gradbišču je treba ravnati v skladu z določili uredbe o emisiji snovi in toplote pri odvajanju odpadnih voda iz virov onesnaževanja (Uradni list RS, št. 35/96),
-
paziti je treba, da ne bodo v vodo odtekale snovi, ki se uporabljajo za zagon in delovanje gradbenih strojev in transportnih sredstev (bencin, nafta, mineralna olja),
-
pred pričetkom gradnje, posebej še pred posegom v akumulacijo Pernica, je treba o predvidenem začetku in poteku del obvestiti upravljavce, ki z obravnavanimi vodotoki in vodnimi površinami gospodarijo, ob regulacijskih posegih morajo za vse posege določiti ukrepe za omilitev vplivov, ki morajo biti izvedeni pred posegom,
-
v staro strugo reke Pesnice izven območja načrtovanih ureditev ni dovoljeno posegati, prav tako niso dovoljeni poseki vegetacije izven obsega gradbišča,
-
pri gradnji ni dovoljeno uporabljati materialov, ki vsebujejo nevarne spojine kot so klorirane organske spojine, toksične kovine in druge sestavine, ki lahko spremenijo osnovne lastnosti vode,
-
utrjene površine (ploščadi), na katerih se izvaja pretakanje goriv in manjša popravila tehničnih naprav je treba urediti tako, da ni možno neposredno odtekanje odpadnih in izcednih vod v tla; izgradnja utrjenih ploščadi opremljenih z začasnimi izbirnimi kanali in zbiralnikom vod ter lovilcem olj (možni ukrepi za ravnanje z odpadnimi vodami) naj bo predvidena že v okviru programa organizacije del oziroma gradbišča,
-
komunalne in padavinske odpadne vode iz premičnih naprav je treba pred odvajanjem v vode očistiti tako, da stopnja onesnaženosti ne presega mejnih vrednosti opredeljenih v uredbi o emisiji snovi in toplote pri odvajanju odpadnih voda iz virov onesnaževanja (Uradni list RS, št. 35/96). Zgraditi je treba ustrezne usedalnike, izvajati nevtralizacijo ali s pomočjo druge ustrezne tehnologije izpolniti zahteve iz navedenega predpisa,
-
za vode v zadrževalnikih mora zadrževalni čas omogočati učinkovito sedimentiranje trdnih delcev in delno razgradnjo organskih snovi; zbiralnike je treba redno vzdrževati pri tem je treba mulj obravnavati kot posebni odpadek,
-
na odsekih, kjer so načrtovani vkopi, t.j. v km 6+060 – km 6+420 in km 6+630 – km 6+850, je treba previdno in pod geološkim nadzorom izvrševati izkopna dela in previdno ravnati z nevarnimi snovmi (olja, maziva, goriva). Pri posegih v vodonosnik je treba uporabljati čisto tehnologijo,
-
v primeru osušitve vodnjakov v Dragučovi 28 in Močni 37 je treba zagotoviti alternativne rešitve,
-
gradbeni posegi v strugo in brežine površinskih vodotokov in jezera med regulacijskimi deli, v času drugih gradbenih del in v času odstranjevanja mulja (sedimenta) naj se izvajajo tako, da v potoku in jezeru ne nastanejo razmere neprekinjene povišane vsebnosti suspendiranih snovi.