Specializirani oddelek vodi vodja specializiranega oddelka, ki ga izmed dodeljenih sodnikov z letnim razporedom dela sodnikov tega oddelka določi predsednik Vrhovnega sodišča Republike Slovenije. Z letnim razporedom se določi tudi namestnika vodje specializiranega oddelka.
Vodja specializiranega oddelka skrbi za nemoteno delo na oddelku, za pravilnost dodeljevanja zadev, odloča o ustanovitvi dodeljevanja zadev, dodeljenih članom specializiranega oddelka, pripravlja posvetovanja sodnikov oddelka, organizira izobraževanja, na zahtevo predsednika Vrhovnega sodišča Republike Slovenije poroča o delu oddelka, redno obvešča senat Vrhovnega sodišča o stanju zadev in obremenitvah sodnikov na oddelku in v zvezi z zadevami, ki so dodeljene sodnikom oddelka, izvaja pooblastila, ki jih ima po tem sodnem redu, zakonu, ki ureja sodišča, zakonu, ki ureja kazenski postopek in zakonu, ki ureja varstvo pravice do sojenja brez nepotrebnega odlašanja, razen odločanja o zahtevi stranke za izločitev sodnika.«