Program dela za posamezen namen iz točke C) 1. člena uredbe sprejme minister na podlagi letnih programov zainteresiranih vlagateljev, ki jih oceni posebna komisija, ki jo imenuje minister.
Komisija izdela predlog programa, v katerem določi tudi višino sredstev za posameznega upravičenca.
Na podlagi sklepov o dodeljenih sredstvih in letnih programov ministrstva sklene ministrstvo z upravičenci pogodbe, s katerimi natančneje uredi način in pogoje koriščenja dodeljenih sredstev.