SIST pridobiva sredstva za opravljanje svoje dejavnosti:
SIST v skladu z veljavno zakonodajo ločeno vodi in prikazuje sredstva, ki jih prejme iz proračuna oziroma od drugih javnofinančnih institucij, od prihodkov od prodaje blaga in storitev na trgu.
Višina sredstev iz državnega proračuna se določi na podlagi letnega programa dela. SIST predloži sprejeti finančni načrt in program dela v soglasje ministrstvu pristojnemu za notranji trg, v skladu z zakonom, ki ureja izvrševanje proračuna Republike Slovenije.