Organ upravljanja centra je svet.
Svet šteje devet članov, od katerih šest članov imenuje Vlada Republike Slovenije, in sicer:
Tri člane izvolijo delavci centra na neposrednih in tajnih volitvah po postopku, določenem s statutom centra.
Predsednika imenuje svet izmed članov, ki jih je na predlog ministrstva, pristojnega za šolstvo in šport, imenovala Vlada Republike Slovenije.
Svet sklepa veljavno, če je na seji navzoča večina vseh članov.
Svet veljavno sprejme odločitev z večino glasov navzočih članov, razen statuta in letnega programa dejavnosti, ki se sprejemata z večino glasov vseh članov sveta.