Zavod upravlja svet zavoda, ki ga sestavljajo:
-
predstavnika ustanovitelja (dva člana), ki ju imenuje Vlada Republike Slovenije,
-
predstavnika delavcev zavoda (dva člana), ki se volita na neposrednih volitvah,
-
predstavnika zainteresirane javnosti (dva člana), ki ju imenujeta Zveza društev likovnih umetnikov Slovenije in Akademija za likovno umetnost Ljubljana.
Mandat članov sveta traja pet let; po poteku mandata so lahko izvoljeni še za eno mandatno obdobje.