Ministrstvo za izobraževanje, znanost in šport Republike Slovenije madžarski strani nudi do 12 mesečnih štipendij za podiplomski študij prek Centra Republike Slovenije za mobilnost in evropske programe izobraževanja in usposabljanja (CMEPIUS). Štipendije se lahko podelijo podiplomskim študentom, mlajšim od 26 let. Štipendije ne smejo biti namenjene za opravljanje celotnega študijskega programa. Vsaka posamezna mesečna štipendija se lahko podeli za 3–10 mesecev.
Slovenska stran vsako leto odobri tri dvotedenske štipendije madžarskim študentom, ki študirajo slovenščino, ali raziskovalcem za sodelovanje na poletnih tečajih slovenščine.
Poleg tega slovenska stran spodbuja študente in raziskovalce iz Madžarske, da se z drugimi možnostmi štipendiranja seznanijo na spletni strani: http://www2.cmepius.si/en/ in www.sklad-kadri.si/en.