Za izvajanje uredb iz prejšnjega člena in te uredbe sta pristojna Ministrstvo za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano in Carinska uprava Republike Slovenije, v delu, v katerem se nanašajo na prehranska dopolnila in živila za posebne prehranske oziroma zdravstvene namene, pa Ministrstvo za zdravje.
Podatke Evropski komisiji v zvezi z izvajanjem te uredbe pošiljata ministrstvo, pristojno za zdravje, in ministrstvo, pristojno za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano, vsako v skladu s svojimi pristojnostmi.