Generalni direktor UKC predstavlja in zastopa UKC. Organizira in vodi delo ter poslovanje UKC. Odgovarja ustanovitelju za poslovni uspeh UKC, za uravnoteženje poslovnih in strokovnih interesov ter za zakonitost poslovanja. Generalni direktor UKC predlaga temelje poslovne politike in načrte razvoja UKC.
Generalnega direktorja UKC imenuje in razrešuje svet UKC s soglasjem Vlade Republike Slovenije. Imenuje se na podlagi javnega razpisa.
Za generalnega direktorja UKC je lahko imenovan kandidat, ki izpolnjuje z zakonom predpisane pogoje in:
Mandat generalnega direktorja UKC traja štiri leta in je lahko ponovno imenovan.
V času svojega mandata generalni direktor UKC ne sme zasedati drugih delovnih mest v UKC, na katerih se opravljajo naloge, vezane na mandat.