Upravni odbor opravlja zlasti naslednje naloge:
1.
oblikuje predlog finančnega načrta in ga posreduje v sprejem skupščini;
2.
obravnava in spremlja sistemska vprašanja s področja zdravstvenega zavarovanja in OZDO ter daje pobude za spremembe;
3.
v skladu z zakonom potrjuje letno poročilo;
4.
sprejema začasne ukrepe za sanacijo presežkov odhodkov nad prihodki;
5.
odloča o pristopu k dogovoru za izvajanje programov zdravstvenih storitev in oblikovanju izhodišč za njegovo izvajanje;
6.
predlaga skupščini zavoda razporeditev presežka prihodkov nad odhodki;
7.
v skladu s splošnim aktom odloča o odlogu, zmanjšanju ali odpisu prispevkov za obvezno zdravstveno zavarovanje posameznim zavezancem in drugih obveznosti posameznih zavezancev;
7.
predlaga spremembe prispevnih stopenj za poškodbe pri delu in poklicno bolezen;
9.
odloča o uporabi rezervnih sredstev obveznega zdravstvenega zavarovanja;
8.
obravnava in sprejema poročila o poslovanju med letom in o tem po potrebi poroča skupščini;
9.
sprejme sklep o razpisu za sklepanje pogodb za opravljanje programa zdravstvenih storitev in izbere izvajalce zdravstvenih storitev;
10.
odloča o odpisu neplačanih in zastaranih terjatev in obveznosti ter o odpisu sredstev zavoda;
11.
sprejema pravilnik o notranji organizaciji zavoda in druge splošne akte zavoda, razen aktov, za katere je pooblaščen generalni direktor zavoda;
12.
v okviru finančnega načrta med letom prerazporeja sredstva po posameznih namenih;
13.
določa materialne okvire in pogoje za delo službe zavoda;
14.
objavlja razpis za generalnega direktorja in predlaga kandidata;
15.
določa vsebino in sklepa pogodbo o zaposlitvi za generalnega direktorja;
16.
daje mnenje k imenovanju direktorjev področij ter k imenovanju direktorjev območnih in področnih enot;
17.
imenuje imenovane zdravnike in člane zdravstvene komisije;
18.
imenuje komisije in delovne skupine za opravljanje določenih nalog s svojega delovnega področja in jim določa delovno področje;
19.
imenuje predstavnike zavoda v svete zdravstvenih zavodov in predlaga Vladi Republike Slovenije v imenovanje predstavnike zavarovancev v organe upravljanja zdravstvenih zavodov na terciarni ravni zdravstvene dejavnosti;
20.
predlaga v imenovanje ministru, pristojnemu za dolgotrajno oskrbo, predstavnika zavoda v strokovni svet za dolgotrajno oskrbo;
21.
obravnava poročilo o izvajanju nadzora in o ukrepih za odpravo ugotovljenih nepravilnosti;
22.
predlaga skupščini sprejem aktov iz njene pristojnosti;
23.
odloča o pristopu k dogovoru o preskrbi z medicinskimi pripomočki in na njegovi podlagi sprejme sklep o razpisu in izbere dobavitelje ter sprejme sklep o razpisu za medicinske pripomočke, ki niso predmet tega dogovora in izbere subjekte, ki zagotavljajo te medicinske pripomočke;
24.
določa način obračunavanja in izplačevanja nadomestila med začasno zadržanostjo od dela;
25.
opravlja naloge organa nadzora v skladu z usmeritvami za državno notranje revidiranje, ki so izdane na podlagi zakona, ki ureja javne finance;
26.
opravlja druge izvršilne naloge in odloča o vprašanjih zdravstvenega zavarovanja in OZDO, za katere ni izrecno pristojna skupščina.
Upravni odbor lahko v primerih iz 8., 12., 13. in 21. točke prejšnjega odstavka, prenese pooblastilo na generalnega direktorja zavoda. Obseg pooblastila določi v sklepu o pooblastitvi.