V Pravilniku o izvajanju poskusa fleksibilnega predmetnika v osnovni šoli (Uradni list RS, št. 53/06) se 12. člen spremeni tako, da se glasi:
"Pri izvajanju poskusa fleksibilnega predmetnika se pri preverjanju, ocenjevanju znanja ter napredovanju učencev uporabljajo določbe pravilnika, ki ureja preverjanje, ocenjevanje in napredovanje učencev v devetletni osnovni šoli, razen določb, ki jih ta pravilnik drugače ureja.
Znanje učencev se pri predmetih, ki se izvajajo vse šolsko leto, oceni najmanj šestkrat v šolskem letu, znanje učencev pri predmetih, ki se izvajajo strnjeno zgolj v enem ocenjevalnem obdobju in imajo letno 70 ali več ur pouka po predmetniku se oceni najmanj štirikrat, znanje učencev pri predmetih, ki se izvajajo strnjeno in imajo letno 52,5 oziroma 48 ur pouka po predmetniku se oceni najmanj trikrat in znanje učencev, ki imajo letno 35 oziroma 32 ur pouka po predmetniku se oceni najmanj dvakrat v šolskem letu. Ocene morajo biti pridobljene enakomerno v obdobju, ko se predmet izvaja. V posameznem obdobju mora biti učenec ocenjen tako, da večina ocen ni pridobljena na podlagi pisnih izdelkov.
V oddelku, v katerem se izvaja poskus fleksibilnega predmetnika, učitelj ob koncu izvajanja predmeta oblikuje zaključno oceno. Zaključna ocena se vpiše v redovalnico in v obvestilo o učnem uspehu ob koncu ocenjevalnega obdobja med šolskim letom.".