Zavod upravlja upravni odbor, sestavljen iz devetih članov, imenovanih za štiriletni mandat. Odbor imenuje Vlada Republike Slovenije, s tem da neposredno imenuje osem članov za zastopanje interesov države pri upravljanju zavoda, medtem ko enega člana imenuje na predlog delavcev zavoda.
Vlada Republike Slovenije imenuje za člane upravnega odbora, ki zastopajo interese države, predstavnike ministrstev, iz drugega odstavka 6. člena tega zakona in dva predstavnika ministrstva, pristojnega za preskrbo. Za predsednika upravnega odbora imenuje Vlada Republike Slovenije enega izmed predstavnikov ministrstva, pristojnega za preskrbo.
Upravni odbor:
-
sprejme statut zavoda in odloča o zavodovih statusnih spremembah,
-
na predlog direktorja določi v skladu s programom blagovnih rezerv letni program dela in finančni načrt zavoda,
-
sprejme akta o organizaciji zavoda in o sistemizaciji delovnih mest,
-
obravnava letno poročilo zavoda in revizijska poročila,
-
potrjuje bilance,
-
imenuje in razrešuje vodilne delavce zavoda,
-
daje smernice za delo direktorja ter spremlja in nadzoruje njegovo delo,
-
odloča o reviziji, ki se opravlja na zahtevo zavoda, in o izbiri revizijske družbe,
-
nalaga direktorju pripravo poročil o posameznih vprašanjih,
-
odloča o vlaganju kapitala in ugotavlja obseg sredstev blagovnih rezerv,
-
opravlja druge naloge, določene v skladu z zakonom v aktu o ustanovitvi zavoda in statutu zavoda.