Direktor agencije se predčasno razreši:
1.
če to sam zahteva,
2.
če več ne izpolnjuje pogojev za imenovanje,
3.
če stori dejanje, ki je v zakonu, ki ureja položaj javnih uslužbencev, določeno kot hujša disciplinska kršitev,
4.
če svoje delo opravlja nevestno, nestrokovno ali se izkaže, da po delovnih in strokovnih kvalitetah ni primeren za opravljanje dela na položaju direktorja,
5.
če agencija ne dosega zadovoljivih delovnih rezultatov oziroma če pri njenem delu prihaja do ponavljajočih napak ali težje napake.
Za razrešitev direktorja agencije se uporabljajo določbe zakona, ki ureja položaj javnih uslužbencev.