Zavod upravlja z nepremičninami na naslednjih parcelah:
-
parc. št. 2959 poslovna stavba (št. stavbe 57 na naslovu Ljubljana, Prešernova cesta 20), parc. št. 2960 poslovna stavba (št. stavbe 57 na naslovu Ljubljana, Prešernova cesta 20), zelenica, parc. št. 2961 poslovna stavba (št. stavbe 57 na naslovu Ljubljana, Prešernova cesta 20), dvorišče in parc. št. 2962 zelenica, vse v vl. št. 171, k.o. Ajdovščina (šifra 1725),
-
parc. št. 3111 poslovna stavba (št. stavbe 370), v vl. št. 2391, k.o. Tabor (šifra 1737),
-
parc. št. 545/3 sadovnjak, parc. št. 546/1 stavbišče (št. stavbe 427 na naslovu Ivančna Gorica, Vir pri Stični, Vir pri Stični 29), vse v vl. št. 664, k.o. Stična (šifra 1810),
-
grad Snežnik, parc. št. 1.S (št. stavbe 71, 216 in 240), parc. št. 1891, parc. št. 1898, vse v vl. št. 390, k.o. Kozarišče (šifra k.o. 1648),
-
parc. št. 76/1 v vl. št. 475, k.o. Kozarišče (šifra k.o. 1648).
Zavod upravlja tudi z vso opremo, ki je v prostorih iz prejšnjega odstavka, in inventariziranimi muzejskimi predmeti.