Kot možne škodljive učinke GSO, ki vplivajo na raven tveganja, je treba upoštevati zlasti:
-
bolezen človeka, vključno z alergenimi ali toksičnimi učinki,
-
bolezen živali ali rastlin,
-
škodljive učinke, ker bolezni ni mogoče zdraviti ali zagotoviti učinkovite zaščite,
-
škodljive učinke, ki so posledica naselitve ali širjenja GSO v okolju, in
-
škodljive učinke zaradi naravnega prenosa vnesenega genskega materiala v druge organizme.