Če Agencija Republike Slovenije za regionalni razvoj pri izvajanju nalog ugotovi, da RRA ne izpolnjuje pogojev in nalog iz 3. in 5. člena, jo izbriše iz evidence.
Če Agencija Republike Slovenije za regionalni razvoj ugotovi, da RRA opravlja storitve na trgu, ki so nezdružljive z nalogami, ki so v javnem interesu ali ovirajo izvajanje teh nalog, opozori RRA na nepravilnosti in določi rok za njihovo odpravo. O nepravilnostih obvesti tudi regionalni razvojni svet. Če RRA v določenem roku ne odpravi nepravilnosti, jo Agencija Republike Slovenije za regionalni razvoj izbriše iz evidence.