Register vodi Banka Slovenije, ki je tudi odgovorna za pravilno delovanje registra.
Banke, ki vodijo transakcijske račune, morajo Banki Slovenije dnevno zagotavljati podatke o novih transakcijskih računih in njihovih imetnikih ter ažurne podatke o obstoječih transakcijskih računih ter imetnikih transakcijskih računov.
Banke, ki vodijo transakcijske račune imetnikov, so odgovorne za pravilnost in ažurnost podatkov v registru.