Delo in poslovanje Slovenske akreditacije vodi direktor. Mandat direktorja traja pet let in je po izteku mandata lahko imenovan ponovno.
Direktor predstavlja in zastopa Slovensko akreditacijo brez omejitev, odgovoren je za strokovno delo Slovenske akreditacije in za zakonitost njenega dela.
Direktor sprejema splošne akte Slovenske akreditacije skladno s statutom in opravlja druge naloge, določene z zakonom in statutom.