Generalni direktor in tisti vodilni delavci, ki jih kot zastopnike Zavoda na predlog generalnega direktorja imenuje Svet Zavoda, se kot zastopniki Zavoda vpišejo v sodni register in zastopajo Zavod neomejeno.
V primeru zadržanosti oziroma odsotnosti nadomešča generalnega direktorja njegov namestnik s pravicami, pristojnostmi in odgovornostmi na podlagi pisnega pooblastila, ki ga za take primere izda generalni direktor.
Namestnik generalnega direktorja ima tudi druge pristojnosti, odgovornosti in naloge, določene z akti, ki urejajo notranjo organizacijo in sistemizacijo delovnih mest ter s pisnimi pooblastili, ki jih izda generalni direktor.