Zavod odgovarja za svoje obveznosti z vsem premoženjem, ki ga ima v upravljanju. Subsidiarno odgovarja za njegove obveznosti Republika Slovenija do višine sredstev, ki se v tekočem letu zagotavljajo iz proračuna Republike Slovenije za delovanje zavoda.
Ustanovitelj ne odgovarja za obveznosti zavoda iz naslova drugih dejavnosti, ki jih zavod opravlja za druge naročnike.
Zavod prevzema odgovornost za dobro gospodarjenje s sredstvi, namenjenimi za svojo dejavnost ter odgovornost dobrega gospodarja za upravljanje s sredstvi, ki so last ustanovitelja.
Zavod vsako leto pripravi program dela, finančni načrt in letno poročilo zavoda ter jih posreduje ustanovitelju v soglasje.