V utemeljitvi strokovnega mnenja se navede značilnosti ravnanja z GSO in elemente iz ocene tveganja, ki so bistveni za opredelitev strokovnega mnenja. Ovrednoti se tveganje za zdravje in okolje in primernost varstvenih in drugih ukrepov, ki so predvideni v zvezi z ravnanjem z GSO, ki je predmet prijave.
Utemeljitev vsebuje navedbo razlogov, ki so vplivali na mnenje odbora o tem, da ravnanje z GSO izpolnjuje ali ne izpolnjuje pogojev za izdajo potrdila ali dovoljenja.
V primeru, da po mnenju odbora ravnanje z GSO izpolnjuje pogoje za izdajo potrdila ali dovoljenja, se lahko v utemeljitvi predlagajo tudi dodatni pogoji, ki morajo biti izpolnjeni glede varstvenih ali drugih ukrepov, če se ravnanje z GSO dovoli.
Utemeljitev strokovnega mnenja vsebuje tudi morebitno ločeno mnenje člana ali namestnika, ki se ne strinja z večinsko odločitvijo o strokovnem mnenju ali njegovi utemeljitvi in to zahteva.