Zavod pridobiva sredstva na podlagi Programa dela zavoda, h kateremu je dala soglasje Vlada Republike Slovenije. Program je pripravljen za obdobje petih let in vsebuje:
Program dela zavoda pripravi direktor na predlog vodij organizacijskih enot ter vodij raziskovalnih in programskih skupin. Upravni odbor zavoda po predhodnem mnenju Znanstvenega sveta sprejme Program dela zavoda.
Zavod pridobiva sredstva za izvajanje nalog iz tretjega in četrtega odstavka 3. člena v skladu z merili ministrstva, pristojnega za rudarstvo, in ministrstva, pristojnega za okolje in prostor.