Upravljanje parka spremlja Odbor Krajinskega parka Sečoveljske soline, ki zagotavlja koordinacijo lokalnih interesov in sodelovanje občine, na območju katere leži naravna vrednota, pri upravljanju parka.
Pristojnosti Odbora Krajinskega parka Sečoveljske soline so:
Odbor Krajinskega parka Sečoveljske soline ustanovi minister, ki določi število članov odbora, ki mora biti liho, in imenuje predsednika odbora ter polovico članov odbora. Polovico članov odbora imenujejo lokalne skupnosti, ki so na zavarovanem območju.