Na podlagi pravnomočne odločbe, s katero je bila posameznemu kandidatu odobrena specializacija, plačnik stroškov specializacije pred začetkom opravljanja specializacije sklene z zbornico posebno pogodbo, s katero se določi način obračunavanja in plačevanja stroškov specializacije ter druge medsebojne obveznosti v zvezi s specializacijo.
Plačnik specializacije je lahko izvajalec javne službe v zdravstveni dejavnosti, druga pravna ali fizična oseba, pri kateri je specializant zaposlen ali specializant sam (samoplačnik).
Višino stroškov specializacije, ki vključuje tudi stroške izpita, določi zbornica v soglasju z ministrom, pristojnim za zdravje.