Za izvajanje tega sporazuma pristojna organa ustanovita skupni odbor za znanstveno in tehnološko sodelovanje (v nadaljevanju skupni odbor), sestavljen iz enakega števila predstavnikov in strokovnjakov, ki jih imenujeta pristojna organa.
Skupni odbor pripravi izhodišča za sodelovanje, vključno s finančnimi vprašanji. Skupni odbor načrtuje in usklajuje sodelovanje v znanosti in tehnologiji ter pregleduje napredek pri tem sodelovanju. Sprejema dveletne programe sodelovanja, nadzoruje njihovo izvajanje in po potrebi predlaga konkretne ukrepe za uresničevanje rezultatov sodelovanja.
Skupni odbor se sestaja vsaki dve leti ali na zahtevo ene od pogodbenic izmenično v Republiki Sloveniji in Republiki Albaniji.
Skupni odbor se ustanovi najpozneje 6 mesecev po začetku veljavnosti tega sporazuma.