Za organizacijo in nadzor nad delom oddelkov in šol iz tretjega in četrtega člena tega sporazuma bo skrbelo Ministrstvo za šolstvo in šport Republike Slovenije kot edino pristojno za organizacijo izobraževanja državljanov Republike Bosne in Hercegovine – začasnih beguncev v Republiki Sloveniji.
Pri tem bo Ministrstvo za šolstvo in šport Republike Slovenije sodelovalo z Ministrstvom za izobraževanje, znanost, kulturo in šport Republike Bosne in Hercegovine oziroma z njegovimi pooblaščenimi predstavniki.