Kakovost vode in posledice obremenjevanja po tej uredbi, se ugotavlja za vsako leto posebej, na podlagi rezultatov analiz vzorcev vode, ki se jih pridobi z rednim in enakomernim vzorčevanjem.
Mejne in priporočene vrednosti fizikalnih, kemijskih in mikrobioloških parametrov kakovosti vode so določene v prilogi 1, ki je sestavni del te uredbe.
Merilna mesta, minimalna pogostost vzorčenja, metode vzorčenja in način ter obliko sporočanja podatkov so določeni s predpisi, ki urejajo monitoring kakovosti vode za življenje in rast morskih školjk in morskih polžev.