Organi SOS so:
-
skupščina,
-
predsedstvo sekcije,
-
predsedstvo,
-
glavni odbor,
-
nadzorni odbor.
V organe so lahko izvoljeni župani občin članic. Izvoljeni so za mandatno obdobje štirih let v volilnem obdobju. Mandati pripadajo občini in ne izvoljenemu zakonitemu zastopniku občine članice, razen za predsednike in podpredsednike sekcij v zadnjih 6 mesecih štiriletnega mandatnega obdobja predsedstva, ko ta sekcija predseduje SOS.