Poslovni odbor je kolegijski posvetovalni organ, ki predlaga, obravnava in usmerja usklajenost strokovne dejavnosti z ekonomskimi možnostmi, smotrno organizacijo dela, zaposlovanje, nabavo opreme, sklepanje pogodb s plačniki zdravstvenih storitev iz obveznega zdravstvenega zavarovanja, ceno zdravstvenih storitev in druga vprašanja v skladu s pooblastili, ki jih določi statut KC. Poslovni odbor obravnava tudi zdravstveno dejavnost, ki jo opravljajo organizacijske enote izven obveznega zdravstvenega zavarovanja ter jim posredujejo priporočila in predloge.
Člani poslovnega odbora so direktorji in strokovni direktorji poslovno-strokovnih skupnosti, strokovni direktor KC in generalni direktor KC, ki ga vodi.
Statut zavoda lahko določi tudi druge člane poslovnega odbora.