O uporabi sredstev prihodkov nad odhodki pri izvajanju zdravstvenih programov po pogodbi z Zavodom za zdravstveno zavarovanje Slovenije odloča svet KC na predlog organizacijske enote, ki je prihranek ustvarila, ter s soglasjem ustanovitelja. V primeru izgube mora svet KC na predlog organizacijske enote, kjer je izguba nastala, sprejeti sanacijski program za njeno pokrivanje.
Predlog razporeditve dobička, ki je bil ustvarjen z dejavnostjo izven obveznega zdravstvenega zavarovanja, sestavi organizacijska enota, ki ga je ustvarila. Način razporejanja dobička in pokrivanje morebitne izgube, se določi s pravilnikom, ki ga sprejme svet KC v soglasju z ustanoviteljem.
Če organizacijske enote pri opravljanju zdravstvenih storitev izven obveznega zdravstvenega zavarovanja v poslovnem letu ustvarijo izgubo, so dolžne predložiti sanacijski načrt. Generalni direktor lahko opravljanje te dejavnosti začasno prepove.
Pred izdelavo letnega zaključnega računa je KC dolžan izdelati izkaz uspeha za posamezno stroškovno mesto.