Nadzor nad izvajanjem ciljnega raziskovalnega programa opravlja nadzorni svet, ki ga imenuje minister v sodelovanju s pristojnim ministrstvom izmed delavcev ministrstev in strokovnjakov.
Nadzorni svet:
-
najmanj polletno pregleda stanje glede izvajanja ciljnega raziskovalnega programa z vidika nacionalnih ciljev, organizacije dela in financiranja programa,
-
redno poroča ministrstvu in pristojnim resornim ministrstvom o poteku programa,
-
predlaga ministrstvu in pristojnim resornim ministrstvom organizacijske, kadrovske, finančne in druge ukrepe, ki naj izboljšajo ciljni raziskovalni program, njegovo izvajanje in učinke pri podpiranju nacionalnih ciljev.