Komisijo iz 10. člena tega navodila sestavljajo najmanj trije člani, ki so strokovnjaki za področja oziroma dejavnosti, na katere se nadomestitev dela stroškov nanaša. Pri delu komisije sodeluje tudi strokovni delavec ministrstva, vendar brez pravice glasovanja.
Člani komisije ne smejo biti zaposleni, pogodbeno vezani ali imeti lastniških delov oziroma biti člani organov upravljanja pri delodajalcu, ki je podal vlogo.
Delo komisije vodi strokovni delavec ministrstva oziroma član komisije, ki ga določi ministrica.
Strokovna opravila za komisijo opravljajo delavci ministrstva.