Zavod v skladu z zakonom izvaja:
1.
nadzor nad uveljavljanjem pravic iz zdravstvenega zavarovanja,
2.
nadzor nad pravilnostjo obračunavanja denarnih dajatev iz obveznega zdravstvenega zavarovanja,
3.
nadzor nad obračunavanjem zdravstvenih storitev,
4.
nadzor nad uresničevanjem pogodb z izvajalci,
5.
nadzor nad obračunavanjem, plačevanjem in izterjavo prispevkov,
6.
interni nadzor nad (finančnim) poslovanjem zavoda.