Koordinacijo centrov sestavljajo svet in člani koordinacije centrov, ki so predstavniki vsakega posameznega centra za preprečevanje in zdravljenje odvisnosti od prepovedanih drog, dva predstavnika Ministrstva za zdravstvo ter dva predstavnika javnega zavoda centra za zdravljenje odvisnih od prepovedanih drog.
Svet iz prejšnjega odstavka sestavljajo predsednik koordinacije centrov, ki je predstavnik centra za zdravljenje odvisnih od prepovedanih drog in štirje člani koordinacije centrov, od katerih je eden namestnik predsednika.
Člane koordinacije centrov in sveta imenuje minister, pristojen za zdravstvo, za dobo 4 let.