Strokovni organ zavoda je strokovni svet. Strokovni svet sestavljajo člani, ki jih imenuje svet izmed strokovnih delavcev zavoda in zunanjih strokovnjakov s področja dela zavoda. Predsednika in polovico članov strokovnega sveta imenuje svet zavoda po svoji izbiri, ostale člane pa na predlog Kulturniške zbornice Slovenije.
Sestavo, način imenovanja, trajanje mandata članom in naloge strokovnega sveta določi statut zavoda.