Pred izdajo sklepa o dodelitvi sredstev se mora preveriti verodostojnost vloge.
Med izvedbo investicije, v primeru vmesnih izplačil sredstev ter v primeru, da upravičenec nepravočasno izvaja obveznosti, določene v pogodbi iz prvega odstavka 30. člena te uredbe, se še pred izplačilom na zahtevo agencije opravi inšpekcijski nadzor na kraju samem. Zahtevi za inšpekcijski nadzor se priloži dokumentacijo upravičenca, pri katerem se opravlja inšpekcijski nadzor.
Ob koncu izvedbe investicije se na zahtevo agencije opravi inšpekcijski nadzor na kraju samem. Zahtevi za inšpekcijski nadzor se priloži vso dokumentacijo, ki jo je upravičenec posredoval agenciji v času od zadnjega inšpekcijskega pregleda do konca izvedbe investicije.
Zahtevo za inšpekcijski pregled investicije na kraju samem lahko agencija poda še pet let po zaključku investicije. Pregled se opravi na vzorcu 5–10% vseh izplačanih vlog, izbranih na podlagi analize tveganja.
Inšpekcijski pregled investicije na kraju samem se mora opraviti na podlagi prijave o morebitnih nepravilnostih pri vlagatelju ali pri upravičencu.
Vloge za dodelitev sredstev mora agencija hraniti še pet let od dneva, ko je bilo izvršeno končno izplačilo sredstev upravičencu.