Zavod aktivno sodeluje pri dejavnostih Občine Idrija, povezanih s projektom nominacije za vpis dediščine živega srebra v Idriji na UNESCO Seznam svetovne dediščine in v ta namen vzpostavlja in zagotavlja komunikacijo z vsemi pristojnimi ustanovami in organizacijami na državni in mednarodni ravni ter sodeluje pri pripravi s tem povezanih gradiv.
Na področju premične kulturne dediščine zavod sklene sporazum o sodelovanju z Mestnim muzejem Idrija, pristojnim za varstvo premične in žive dediščine na območju Idrijskega in Cerkljanskega.
Zavod pri svojem delu redno sodeluje s strokovnimi organizacijami in zavodi, znanstveno raziskovalnimi in izobraževalnimi ustanovami, zainteresirano javnostjo, zasebniki in posamezniki, ki opravljajo svojo dejavnost na področju delovanja zavoda in drugimi, ki lahko s svojim delom in dosežki aktivno prispevajo k uspehu pri delovanju zavoda.
Zavod se samostojno odloča o včlanitvi v domača in mednarodna združenja in zveze, ki so v svojih ciljih sorodna dejavnosti in namenu ustanovitve zavoda.