Zadeve pravosodne uprave, ki zadevajo sodišča, opravlja Republiški sekretariat za pravosodje, organizacijo uprave in proračun.
Med zadeve pravosodne uprave spadajo zlasti zadeve v zvezi z organizacijo dela in poslovanjem sodišč, nadzorstvo nad opravljanjem zadev sodne uprave, mednarodna pravna pomoč ter statistika in evidenca o delu sodišč, pomembna za SR Slovenijo.
Za opravljanje posameznih zadev v zvezi s nadzorstvom nad opravljanem zadev sodne uprave lahko pooblasti Republiški sekretar za pravosodje, organizacijo uprave in proračun predsednike sodišč višje stopnje.
Vrhovno sodišče SR Slovenije s splošnim aktom samostojno določa notranjo organizacijo in poslovanje sodišča v skladu s posebnimi nalogami, ki jih ima po ustavi in zakonu.